1.鸡霍乱流行时，往往鸡、鸭、鹅同时发病死亡，而新城疫只有鸡发病。
2.症状：鸡霍乱急性病例嗉囊充满食物，而新城疫充满气体和液体，慢性的会出现扭头颈等神经症状，鸡霍乱则无神经症状，病程短促。
3.剖检：鸡霍乱病心包内积有多量淡黄色液体，心外膜出血，肝表面有灰白色坏死点，气囊和肠管表面常有黄色干酪样渗出物，而新城疫肝脏没有坏死点，腺胃和肌胃角质膜下常有出血或溃疡。
4.鸡霍乱用磺胺类药物或抗生素治疗有一定效果，而新城疫则无效。
5.鸡霍乱的病原是巴氏杆菌，可用普通显微镜检查，而新城疫为病毒所致用普通显微镜不能看到。
